지난 포스팅에 인간의 DNA 분석을 위한 데이터를 정리하였다. 간단히 정리하자면 - FASTQ : DNA를 한 가닥씩 분석하여 4줄씩 저장한 파일 - BAM : FASTQ파일을 인간표준유전체와 비교하여 매핑/정렬한 바이너리 파일 - SAM : BAM파일을 아스키코드로 변환한 파일 이제 이 파일들을 핸들링하기 위해 samtools를 사용할 것이다. 먼저 samtools란 SAM, BAM 및 CRAM 형식의 짧은 DNA 서열 판독 정렬과 상호작용하고 사후 처리하기위한 유틸리티 세트이다. samtools 설치(ubuntu) 아래 사이트에서 다운로드하면 된다. SAMtools/BCFtools/HTSlib - Downloads Current releases SAMtools and BCFtools are distr..