[유전자분석] samtools 유전자 데이터 컨트롤하기
2022. 9. 5. 13:16
엔지니어링/유전자
지난 포스팅에 유전자 데이터와, samtools 을 설치하였다. 이제 samtools 를 사용해보자. 실습에 사용할 데이터는 아래 사이트에서 제공하고 있다. Index of /goldenPath/hg19/encodeDCC/wgEncodeUwRepliSeq hgdownload.cse.ucsc.edu 샘플 파일 다운로드 위 사이트에서 아무거나 다운해보자. $ wget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/wgEncodeUwRepliSeq/wgEncodeUwRepliSeqBg02esG1bAlnRep1.bam BAM -> SAM 변환 다운받은 바이너리형태인 bam 파일을 아스키코드로 된 sam파일로 변환해보자. samtools view {파일명}...